勉強会で今月下旬に扱う明細書は、オートファジーに関する特許出願明細書WO2013/119377 （関連日本出願：特願2014-525205）です。
＊以下の記載は必要に応じて、随時、訂正・加筆する予定です。
この明細書の一部を既に数名の方が担当して翻訳されました。それらの内容は後半で示します。
今日は、新年度、新たな気持ちでバイオ医薬特許翻訳を学ぼうとする人をサポートするため、特許のみならずバイオ医薬の勉強を少しずつしていきます。
翻訳学習者にとって大切なことは、「自分で調べ、自分で学ぶ」ことです。
特許翻訳で求められる翻訳は、直訳であって直訳ではない翻訳です。それを学ぶためには、自分で翻訳し、第三者にチェックしてもらい、チェック内容を議論していくことが大切です。
私の考える特許翻訳者は、
単なる「翻訳マシーン」としてではなく、特許事務所で技術者として明細書作成/中間処理等も従事できる能力を備えた人です。
なぜなら、特許翻訳の産物は、特許権を得るための手段であるからです。
特許取得後の権利行使をも考えることが大事です。
特許事務所の求める翻訳者／技術者をめざしましょう。
米国では、論文作成してそれを仮特許出願として出願し、その後、正式の明細書を準備するという方法が採られています。
ところで、文系の人がバイオテクノロジーの基礎を一通り学ぶにはどうしたらいいでしょうか？
大学で使用されている教科書一冊を一通り読破することです。
FIG. 2
バイオテクノロジーの基礎は細胞生物学（分子遺伝学、生化学、etc.）です。
多くの大学で使われ、大学院受験のテキストにもなっている教科書（Essential Cell Biology 4th Ed.）をベースとして知識のみならず実験方法等の知識を学ぶ。かなりハードですが、ブログで一緒に勉強していきましょう。文系の弱みである実験方法にも力を入れていきましょう。
なお、Essential Cell Biology 4th Ed. の内容は以下の通りです。
TABLE OF CONTENTS
1. Cells: The
Fundamental Units of Life
2. Chemical
Components of Cells
3. Energy,
Catalysis, and Biosynthesis
4. Protein
Structure and Function
5. DNA and
Chromosomes
6. DNA
Replication, Repair, and Recombination
7. From DNA to
Protein: How Cells Read the Genome
8. Control of Gene
Expression
9. How Genes and
Genomes Evolve
10. Modern
Recombinant DNA Technology
11. Membrane
Structure
12. Transport
Across Cell Membranes
13. How Cells
Obtain Energy from Food
14. Energy
Generation in Mitochondria and Chloroplasts
15. Intracellular
Compartments and Protein Transport
16. Cell Signaling
17. Cytoskeleton
18. The Cell
Division Cycle
19. Sexual
Reproduction and the Power of Genetics
20. Cellular
Communities: Tissues, Stem Cells, and Cancer
実験方法は、遺伝子解析の基礎、タンパク質実験の基礎、免疫学実験の基礎、細胞培養の基礎、その他を押さえておきます。
では、冒頭に示したオートファジー関連の明細書の翻訳を検討していきます。
特許について、特許明細書についての説明は、後日、アップします。
今回は、具体的な訳の検討はせず、既に訳された部分をアップし、次回に説明することにします。そのための準備として、明細書に記載されたオートファジーについて、簡単に確認します。
翻訳学習者が「オートファジー」について知るには、最初にGoogle検索で調べるのが一般的です。いくつかのサイトを見て、「オートファジー」がどのような現象であるかを理解することができるでしょう。
急いでいる場合、気になるのは学問的な意味よりも、とりあえずその単語の対訳や英語表現が気になるでしょう。
例えば、Weblio で調べてみると、以下のような英文が出てきます。
In 1988, Osumi
observed autophagy in yeast cells under a light microscope for the first time
ever.
1988年、大隅氏は酵母細胞内でのオートファジーを光学顕微鏡で史上初めて観察した。
Osumi's research
helped uncover the physiological significance of autophagy.
大隅氏の研究はオートファジーの生理学上の重要性を明らかにする助けとなった。
Osumi, 71, won the
prize for his research on autophagy in living cells.
大隅氏(71)は生細胞内のオートファジー(自食作用)に関する研究で受賞した。
「Weblio」で調べる際、気をつけなければならない点は、引用元が「特許庁」になっている英文や和文です。明細書の翻訳文が挙げられているので、必ずしも正しい表現が使われているとは限りません。「英辞郎」も精査されて訳語が載っているとは限りません。
（クイズ： 上記英文例の “microscope” と”microscopy”の違いは？）
ところで、少し生物学を学んだ人ならば、「オートファジー」は「サイトーシス」！？ という疑問が生ずるかもしれません。
オートファジーは、細胞が飢餓状態になっている際に余分なものを自己消化することで栄養源を確保する現象です。細胞内分解機構である「サイトーシス」に似ています。そこで、まず、「サイトーシス」という現象について簡単に触れておきます。
Cytosis （サイトーシス、膜動輸送)
サイトーシスは、細胞内で膜が特定の物質（タンパク質など）を取り囲んで所謂「小胞」となり、他の膜や小胞と融合することで、物質などを輸送するシステムです。
Cytosis は、細胞の中から外へ、外から中へとその輸送の方向に応じて、以下のように呼ばれます。
Exocytosis （エキソサイトーシス、細胞外放出、開口分泌）
Endocytosis (エンドサイトーシス、飲食作用)
Pinocytosis
(“cellular dringking”) (ピノサイトーシス、飲作用)
Phagocytosis
(“cellar eating”) （ファゴサイトーシス、食作用）
autophagy （オートファジー、自食作用）は、endocytic pathway （エンドサイトーシス経路）の一つと考えられます。一言で言えば、細胞内のリサイクル掃除機ともいえます。不要になった細胞内小器官（ミトコンドリアなど）やタンパク質などを膜に包み込んで分解し、リサイクルに回したりします。
Exocytosis の説明図 （「エッセンシャル細胞生物学」原書３版より） FIG. 5
Endocytosis および Autophagy の説明図 （「エッセンシャル細胞生物学」原書３版より）
FIG. 6
オートファジーの研究は、大隈良典氏によって初めて生きた酵母を材料として光学顕微鏡による観察、さらに、酵母のオートファジー関連遺伝子群 （Autophagy related:APG/ATG）を同定しました（Tsukada and Ohsumi,1993）すなわち、オートファジーの研究は、大隈氏らの細胞学的観察から出発して分子遺伝学、生化学的研究へ進み、疾患との関連性なども調べられています。
ところで、大隅氏の研究の特徴の１つとして、酵母を材料にしていることが挙げられます。
endocytosis と autophagy の違いについて
（上段）オートファジーではまず細胞質の一部が隔離膜によって取り囲まれてオートファゴソームが形成される。次にオートファゴソームの外膜がリソソーム膜と融合しオートリソソームとなり、内容物が分解される。
（下段）ユビキチン・プロテアソーム系では、ユビキチン鎖で標識された基質が、プロテアソームによって分解される。これは厳密な認識機構をもった選択的タンパク質分解系である。
では、基本的なところを確認しておきましょう。
タンパク質はどのようにできるか？
DNA上にあるタンパク質の遺伝情報がｍRNAに転写され、さらに翻訳されて複数のアミノ酸の連なったものができあがり、それが折りたたまってタンパク質になります。
セントラルドグマ — 遺伝情報の流れ
（「エッセンシャル細胞生物学」原書３版より）
ｍRNA上の遺伝情報を元にタンパク質合成される場は核の外です。核の外で合成されたタンパク質（まだ完全なタンパク質ではありません）は、ゴルジ体（Golgi body）と呼ばれる複合的な膜系からなる細胞小器官に入ります。工場に原料が届くようなものです。その工場で修飾・加工されます。工場の作業員としてシャペロン（chaperone）さんが活躍します。タンパク質が正しい高次構造になるお助け役です。その後、完成品は小胞で包装されて、さらに別の送付先へと運ばれてきます。
不良品は、ライソゾーム（lysosome）に送られて加水分解されます（リソゾーム系）。または、ユビキチン(ubiqutin)というタンパク質のラベルが結合し、タンパク質複合体であるプロテアソーム（proteasome）によって分解されます（ユビキチン‐プロテアソーム系）。
一方、オートファジーは、不要な細胞小器官（ミトコンドリアなど）や様々な細胞侵入細菌を除去するために、標的を二重膜構造体（オートファゴソーム）で取り囲み、リソソームと融合して標的を分解します。
FIG. 10
大隅氏の特許出願について見てみましょう。大隅氏が発明者として記載されている特許出願は2件です。
（１）特開2000-060574号（出願日： １９９８年８月２１日）
【発明の名称】オートファジーに必須なＡＰＧ１２遺伝子、その検出法、その遺伝子配列に基づくリコンビナント蛋白の作製法、それに対する抗体の作製法、それに対する抗体を用いたＡｐｇ１２蛋白の検出法。
【特許請求の範囲】
【請求項１】 配列番号１、２、３で表されるオートファジーに必須なＡＰＧ１２遺伝子。
【請求項２】 相補的ＤＮＡあるいはＲＮＡを用いた請求項１記載のＡＰＧ１２遺伝子の検出法。
【請求項３】 請求項１記載のＡＰＧ１２遺伝子配列に基づくリコンビナント蛋白の作製法。
【請求項４】 請求項３記載のリコンビナント蛋白の全長または一部に対する抗体の作製法。
【請求項５】 請求項３記載のリコンビナント蛋白に対する抗体を用いたＡｐｇ１２蛋白の検出法。
出願人 株式会社ＬＴＴバイオファーマ
経過： 審査請求しておらず出願は取り下げ
（２）特開2002-348298号（出願日：２００１年５月２３日）
【発明の名称】蛋白質とホスファチジルエタノールアミンの結合体
【特許請求の範囲】（の一部）
【請求項１】 リン脂質と蛋白質がアミド結合で共有結合したリン脂質－蛋白質結合体。
【請求項２】 アミド結合が、リン脂質のアミノ基と蛋白質のＣ末端のカルボキシル基とによるアミド結合である請求項１に記載のリン脂質－蛋白質結合体。
【請求項３】 リン脂質が、ホスファチジルエタノールアミンである請求項１又は２に記載のリン脂質－蛋白質結合体。
【請求項４】 蛋白質が、Ｃ末端がグリシンであるＡｐｇ８又はその誘導体である請求項１～３のいずれかに記載のリン脂質－蛋白質結合体。
出願人 科学技術振興事業団
経過： 第29条柱書違反（産業上利用できない発明）と第36条違反（記載不備）
いずれの特許出願も特許権を得られませんでした。その原因をここでは言及しないことにします。
参考）
特許情報プラットフォーム
発明該当性及び産業上の利用可能性
明細書の記載要件について
このようなわけで、大隅氏の特許出願ではなく、オートファジーに関する他の特許出願明細書WO2013/119377 （関連日本出願：特願2014-525205）を使って、オートファジーの特許翻訳をしてみることにしました。
これらの特許は、例えば、以下のサイトで調べることができます。
次回のブログでは、以下の英文と訳を検討します。
なお、特許事務所では、初心者であっても実際に明細書作成や翻訳をおこない、それを先輩がチェックして育てていきます。
序論
The molecular cascade that regulates and executes autophagy has been the
subject of numerous comprehensive reviews1-4.
したがって、オートファジーは生化学的に（Ａｔｇ８－ＰＥもしくはＬＣ３－ＩＩの生成を評価することによって）または顕微鏡で微視的に（「生化学的に」と表現を合わせる）（例えば蛍光標識されたＡｔｇ８もしくはＬＣ３の局在パターンを観察することによって）検出することができる。
Our laboratory discovered one of the core essential autophagy genes, beclin 16. Beclin 1 is the mammalian ortholog of yeast
Atg6/Vps307.
ベクリン１の発現および／または機能の低下は、癌、アルツハイマー病、ハンチントン病とデスミン関連心筋症対する感受性罹患率（罹病性）の増大；と、微生物病態形成における変化；と、アポトーシス遺骸アポトーシスによる死細胞のクリアランス（又は「除去」）とおよび発生（又は「発達」）における異常；およびと、老化に関連づけられているにつながる９。
ベクリン１が過剰発現するとオートファジーは十分に誘導され１１、および本発明者らの研究室では、ヒト癌において活性化される、上皮増殖因子受容体とＡｋｔとを含む２種の発癌性の増殖シグナル分子が共にベクリン１と相互作用し、ベクリン１のオートファジー機能を阻害することが示された。
【０００１】
[0002] This invention was made with government support
under Grant Number U54A1057156 awarded by the National Institutes of Health
(NIH). The government has certain rights
in the invention.
【発明の概要】
The invention provides methods and compositions for
inducing autophagy.
【０００６】
In one aspect the invention provides an
autophagy-inducing compound or composition comprising (a) an autophagy-inducing
peptide comprising Beclin 1 residues 269-283 immediately flanked on each terminus by no more than twelve
naturally-flanking Beclin 1 residues, wherein up
to six of said residues 269-283 may be substituted, and (b) a first
heterologous moiety, e.g. that promotes therapeutic stability or delivery of
the compound.
【０００７】
Active such compounds have been developed with a
variety of alternative structures and formulations; in various particular
embodiments, such as wherein: the
peptide is N-terminally flanked with T-N and C-terminally flanked by T; the peptide comprises at
least one of F270, F274 and W277; the peptide comprises at least one substitution, particularly of
H275E, S279D or Q281 E; the
peptide is N-terminally joined to the first moiety, and C-terminally
joined to a second heterologous moiety; the peptide is joined to the first
moiety through a linker or spacer; the first moiety comprises a transduction domain, including:
protein-derived (e.g. tat, smac, pen, pVEC, bPrPp, PIs1, VP22, M918, pep-3),
chimeric (e.g. TP, TP10, MPG.DELTA.), and synthetic (e.g. MAP, Pep-1, oligo-Arg)
cell-penetrating peptides; the
first moiety comprises a homing peptide, such as RGD-4C, NGR , CREKA,
LyP-1, F3, SMS, IF7 or H2009.1;
the first moiety comprises a stabilizing agent, such as a PEG, oligo-N-methoxyethylglycine (NMEG), albumin, an albumin-binding
protein, or an immunoglobulin Fc domain; the peptide comprises one or more D-amino acids,
L-.beta.-homo amino acids, D-.beta.-homo amino acids, or N-methylated amino
acids; the peptide is
cyclized; the peptide
is acetylated, acylated, formylated, amidated, phosphorylated, sulfated or
glycosylated; the compound comprises an N-terminal acetyl, formyl, myristoyl,
palmitoyl, carboxyl or 2-furosyl group, and/or a C-terminal hydroxyl, amide,
ester or thioester group; the
compound comprises an affinity tag or detectable label; and/or the peptide is N-terminally
joined to the first moiety, and C-terminally joined to a second heterologous
moiety comprising a detectable label, such as a fluorescent label.
Particular embodiments include all combinations and
subcombinations of particular embodiments, such as wherein: the peptide is
N-terminally flanked with T-N and C-terminally flanked by T, the first moiety
is a tat protein transduction domain linked to the peptide through a diglicine
linker; and the peptide is N-terminally flanked with T-N and C-terminally
flanked by T, the first moiety is a tetrameric integrin .alpha.(v).beta.(6)-binding
peptide known as H2009.1, linked to the peptide through a maleimide--PEG(3)
linker.
In another aspect the invention provides a method of
inducing autophagy, comprising administering to a person in need thereof an
effective amount of a subject compound.
【００１０】
The invention also provides methods and compositions
for identifying modulators of Beclin -1-GAPR-1 interaction.
【００１１】
［課題１」Aさんの訳とBさんのチェック。他に訂正すべき箇所はないか？
【背景技術】
INTRODUCTION
オートファジーを調節し遂行（「実行」とする方が多い）する分子カスケードは、多数の包括的レビューの主題になっている１－４。
The
identification of signals that regulate autophagy and genes that execute
autophagy has facilitated detection and manipulation of the autophagy pathway5.
オートファジーを調節するシグナルとオートファジーを遂行する遺伝子とを特定することにより
、オートファジー経路の検出とおよび操作が容易になってきている５。
Phosphatidylethanolamine
(PE) conjugation of yeast Atg8 or mammalian LC3 results in a nonsoluble form of
Atg8 (Atg8-PE) or LC3 (LC3-II) that stably associates with the autophagosomal
membrane.
酵母Ａｔｇ８または哺乳動物ＬＣ３がホスファチジルエタノールアミン（ＰＥ）と結合すると、オートファゴソーム膜に安定に結合する不溶型のＡｔｇ８（Ａｔｇ８－ＰＥ）またはＬＣ３（ＬＣ３－ＩＩ）がもたらされるになる。
Consequently,
autophagy can be detected biochemically (by assessing the generation of Atg8-PE
or LC3-II) or microscopically (e.g. by observing the localization pattern of
fluorescently tagged Atg8 or LC3).
本出願者ら（「我々」としてもよい）の研究室ではコア必須オートファジー遺伝子オートファジーに必須なコア遺伝子の一つであるベクリン１が発見された６。 ベクリン１は酵母Ａｔｇ６／Ｖｐｓ３０の哺乳動物オルソログである７。
It
interacts with the class III phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K), Vps34, and
is involved in the first step of autophagosome formation8, the
nucleation of the isolation membrane (also known as phagophore) at the
endoplasmic reticulum (a process called autophagic vesicle nucleation).
ベクリン１は、クラスＩＩＩホスファチジルイノシトール３－キナーゼ（ＰＩ３Ｋ）、であるＶｐｓ３４と相互作用し、およびオートファゴソームの形成８の第１段階、すなわち小胞体での隔離膜（ファゴフォアとしても知られている）の核形成（オートファジー小胞核形成と称されるプロセス）に関与している。
Gene
knockout/knockdown studies indicate a conserved requirement for ATG6/beclin 1
in autophagy in plants, slime molds, nematodes, fruit flies, mice, and human
cells9.
遺伝子ノックアウト／ノックダウンの研究により、植物、粘菌、線虫、ショウジョウバエ、マウスおよびヒト細胞のオートファジーにおいてＡＴＧ６／ベクリン１の保存必要条件が必要であることが示されている９。
→文献9の内容からこのような訳になる。conservedをどのように訳出するかが悩みどころ。進化の過程で変化せずに保存されてきたという意味。
Decreases
in Beclin 1 expression and/or function have been linked to increased
susceptibility to cancer, Alzheimer's disease, Huntington's disease, and
desmin-related cardiomyopathy; alterations in microbial pathogenesis; defects
in apoptotic corpse clearance and development; and
aging9.
→developmentが何を意味するのかこの文脈からは分かりにくい。
→；を使用しなくても、～と、～と、～とで表現できることもある。
Beclin
1 encodes a 450 amino acid protein with a central coiled coil domain.
ベクリン１は中心コイルドコイルドメインを有する４５０アミノ酸タンパク質をコードする。
→「４５０アミノ酸タンパク質」は４５０個のアミノ酸からなるたんぱく質のこと。
Within
its N' terminus, it contains a BH3-only domain, which mediates binding to
anti-apoptotic molecules such as Bcl-2 and Bcl -xL10.
該アミノ酸タンパク質のＮ‘末端内にはＢＨ３のみのドメインが含まれており、ＢＨ３のみのドメインは、Ｂｃｌ－２およびＢｃｌ－ｘＬなどの抗アポトーシス分子への結合を仲介媒介するＢＨ３のみのドメインが含まれている１０。
以下はまだチェックしていないので、次回チェックはここから
The
most highly conserved region, referred to as the evolutionarily conserved
domain (ECD), spans from amino acids 244-337, which is important for its
interaction with Vps3410.
進化的に保存されたドメイン（ＥＣＤ）と称される最もよく保存された領域は、アミノ酸２４４～３３７に及んでおり、Ｖｐｓ３４との相互作用にとって重要である１０。
Besides
Vp34 and Bcl-2 family proteins, Beclin 1 has numerous other binding partners,
including Atg14 (another core autophagy protein), UVRAG (a protein that
functions in autophagosomal maturation), Rubicon (a negative regulator of the
Beclin 1/Vps34 complex), and Ambral (a positive regulator of the Beclin 1/Vps34
complex)9.
Ｖｐｓ３４およびＢｃｌ－２のファミリータンパク質以外に、ベクリン１には他にいくつかの結合パートナー、例えばＡｔｇ１４（別の中心的なオートファジータンパク質）、ＵＶＲＡＧ（オートファゴソーム成熟において機能するタンパク質）、ルビコン（ベクリン１／Ｖｐｓ３４複合体の負の調節因子）およびアンブラール（ベクリン１／Ｖｐｓ３４複合体の正の調節因子）がある９。
In
addition, Beclin 1 has been reported to interact with certain receptors and
immune signaling adaptor proteins, including the inositol 1, 4, 5-triphosphate
receptor (IP3R), the estrogen receptor, MyD88 and TRIF, and nPIST, as well as
certain viral virulence proteins such as HSV-1 ICP34, KSHV vBcl-2, HIV-1 Nef,
and influenza M29.
加えて、ベクリン１は、いくつかの受容体と免疫シグナルアダプタータンパク質、例えば、イノシトール１，４，５－三リン酸受容体（ＩＰ３Ｒ）、エストロゲン受容体、ＭｙＤ８８とＴＲＩＦおよびｎＰＩＳＴ、ならびにＨＳＶ－１ ＩＣＰ３４、ＫＳＨＶ ｖＢｃｌ－２、ＨＩＶ－１ ＮｅｆおよびインフルエンザＭ２などのいくつかのウイルス性毒性タンパク質と相互作用することが報告されている９。
Overexpression
of Beclin 1 is sufficient to induce autophagy11, and our laboratory
has shown that two oncogenic growth signaling molecules activated in human
cancers, including the epidermal growth factor receptor and Akt, both interact
with Beclin 1 and inhibit its autophagy function.
［課題２］Cさんの訳
Autophagy-Inducing
Peptide
【発明の名称】オートファジー誘導ペプチド
Abstract
【書類名】要約書
An autophagy-inducing compound comprises an autophagy-inducing
peptide comprising beclin-1 residues 269-283 and a heterologous moiety that
promotes therapeutic stability or delivery of the compound. The compound may be used to induce autophagy
and in assays with beclin-1 binding partners.
要約
オートファジーを誘導する化合物は、ベクリン１残基２６９～２８３を含むオートファジー誘導ペプチドと該化合物の治療安定性または送達を促進する異種部分とを含む。この化合物は、オートファジーの誘導に使用することができるほか、ベクリン１の結合パートナーでの評価に使用することができる。
【書類名】明細書
[0001] Applicants claim priority to U.S.
Ser. No. 61/597,741, filed: Feb. 11, 2012 and is a continuation of
PCT/US13/22350 filed: Jan. 20, 2013.
出願人らは、２０１２年２月１１日に出願された米国特許公開第６１／５９７，７４１号公報及び２０１３年１月２０日に出願されたＰＣＴ／ＵＳ第２２３５０号公報の継続出願の優先権を主張するものである。
【０００２】
本発明は、米国国立衛生研究所（ＮＩＨ）により認可された認証番号第Ｕ５４Ａ１０５７１５６号の下で国家支援によりなされたものである。米国政府は本発明にある権利を有している。
SUMMARY OF THE INVENTION
本発明はオートファジーを誘導する
方法および組成物を提供する。
本発明は、一態様で、（ａ）自然にフランキングしたベクリン１残基によって各端末が直接フランキングされ、最大６個が置換され得るわずか１２個のベクリン１残基２６９－２８３を含むオートファジー誘導ペプチドと（ｂ）例えば、化合物の治療安定性および送達を促進する第一のヘテロジニアス部分を含むオートファジー誘導ペプチドまたは化合物を提供する。
【０００８】
かかる活性な化合物は、様々な特定の実施形態において、例えば、ペプチドのＮ端末がＴ－Ｎでフランキングされ、Ｃ端末がＴでフランキングされる；ペプチドがＦ２７０、 Ｆ２７４、Ｗ２７７のうちの少なくとも１つを含む；ペプチドが、とりわけＨ２７５Ｅ、Ｓ２７９Ｄ、またはＱ２８１Ｅの置換物を少なくとも１つ含む；ペプチドのＮ端末が第一の部分に結合され、Ｃ端末が第二の部分に結合される；ペプチドがリンカーまたはスペーサーを介して第一の部分に結合される；第一の部分が、タンパク質に誘導された（例えば、tat, smac、 pen、pVEC、bPrPp, PIs1、 VP22、 M918、pep-3）、キメラの（例えば、TP、 TP10、 MPG、DELTA.）、および合成された（例えば、MAP、Pep-1、 oligo-Arg）細胞貫通性ペプチドを含む形質導入ドメインを含む；第一の部分が、RGD-4C、 NGR、 CREKA、 LyP-1、 F3、SMS、 IF7または H2009.1などのホーミングペプチドを含む；第一の部分が、PEG、 オリゴＮメトキシエチルグリシン（NMEG）、アルブミン、アルブミン結合タンパクまたは免疫グロブリンＦｃドメインなどの安定化剤を含む；第一の部分が１つまたは複数のＤアミノ酸、Ｌベータホモアミノ酸、またはＮ端末がメチル化されたアミノ酸を含む；ペプチドが環化される；ペプチドがアシル化、アセチル化、アミノ化、ホルミル化、アミド化、リン酸化、硫酸化、またはグリコシル化される；化合物のＮ端末がアセチル基、ホルミル基、ミリストイル基、パルミトイル基、カルボキシル基、または２－フロシル基、および／または、Ｃ端末がアミド基、エステル基、またはチオエステル基を含む；化合物がアフィニティー標識または検出可能なラベルを含む；および／または、ペプチドのＮ端末が第一の部分に結合され、Ｃ端末が蛍光ラベルなどの検出可能なラベルを含む、などの様々な代替構造および処方で開発されてきた。
【０００９】
特別な実施形態には、ペプチドのＮ端末がＴ－Ｎでフランキングされ、Ｃ端末がＴでフランキングされ、第一の部分がジグリシン・リンカーを介してペプチドに結合されたＴａｔタンパク導入ドメインである；ペプチドのＮ端末がＴ－Ｎでフランキングされ、Ｃ端末がＴでフランキングされ、第一の部分がマレイミド（PEG(3)リンカー）を介してペプチド結合されたH2009.1として知られる四量体インテグリンα（ｖ）β（６）に結合するペプチドである、などの特別な実施形態の組み合わせおよび部分組み合わせのすべてが含まれる。
本発明は、別の様相で、有効な量の対象化合物を必要に応じてヒトに投与することを含むオートファジーを誘導する方法を提供する。
本発明はまた、ベクリン１とGAPR１との相互作用を識別する方法および組成物を提供もする。
